植被构建
浅水区种植挺水-浮水植物，深水区有序选择苦草、菹草、金鱼藻、伊乐藻、眼子菜等多种沉水植物构建水下森林，共同营造水生植被系统。对水体的富营养化物质N、P进行同化吸收，降低水体溶解性的N、P等物质，对水体透明度大幅度提升，同时增强景观度。
生态浮岛
对一些底质硬化且水域较深而无法原位种植水生植物的水体利用浮载体培养净化、景观效果均较好的植物（水生植物或一些岸生湿生植物），对水体进行一定程度的生态净化。
水生动物调控
通过人工生物操纵手段，在水域投放一定比例水生动物（鱼、贝、虾等），形成微生物－水生植物－水生动物组成的结构复杂和功能完善的水生生态系统，恢复和提高水体的自净能力。